Ya han jugado dos veces en la Copa.
Junior se vuelve a enfrentar contra Millonarios en la modadlidad de play offs. En esta ocasión ambos equipos se verán las caras por un cupo en la semifinal de la Copa Águila. Desde 2004 ya se han medido también en duelos de eliminación directa en Liga y Copa Sudamericana. Las estadísticas le favorecen al cuadro ‘Tiburón’, a excepción de la Copa Colombia.
Copa Sudamericana
Primera ronda: Millonarios 1 – Junior 0; Junior 2 – Millonarios 0.
Liga (Todas las series se definieron a favor de Junior en penales)
2011 Semifinales: Millonarios 3 – Junior 0; Junior 3 – Millonarios 0 (JUN 3 - MIL 2)
2014 Semifinales: Junior 0 – Millonarios 0; Millonarios 0 – Junior 0 (JUN 5 - MIL 4)
2016 Cuartos de final: Junior 2 - Millonarios 0; Millonarios 4 - Junior 2 (MIL 2 - JUN 4)
Copa Colombia
En la Copa Colombia al cuadro currambero no le ha ido muy bien cuando se ha topado con ‘Millos’, en todos los encuentros que se han topado no ha podido lograr una victoria, ni un empate.
2011 Semifinales: Millonarios 4 – Junior 1; Junior 0 – Millonarios 0
2013 Octavos de final: Millonarios 2 – Junior 0; Junior 2 – Millonarios 0. (MIL 3 - JUN 0)